卵园孔未闭（PFO）最常伴随的临床综合征是栓塞（尤其是卒中）和偏头痛。所以PFO是否需要治疗主要取决于PFO与卒中及偏头痛（尤其是卒中）之间是否有病因学关系。有研究提示PFO可能是卒中的潜在危险因素，但临床研究结果尚存在分歧。治疗性研究支持PFO与偏头痛有关，但是偏头痛与是否伴有右向左分流之间的关系尚不明确。